如果将示例文件移动到新位置,或者重命名文件路径中的文件夹,则 FlowJo 工作区在重新打开时可能无法找到示例文件。如果发生这种情况,请不要担心。有一种简单的方法可以将文件重新连接到工作区,而无需重新分析数据。
如何将示例文件重新连接到 FlowJo 工作区:
样本名称左侧的圆圈标记显示文件是否已连接到工作区。如果您看到圆圈中有一个大红色 X,则表示您的文件未连接,您需要向工作区显示这些文件所在的位置,然后才能继续分析。
选项 1-要重新连接文件,请右键单击(或按住 Control 键单击)带有红色 X 徽章的样本,然后选择搜索 FCS 文件...
这将打开一个浏览器窗口。
导航到包含 FCS 文件的文件夹。选择该文件夹并单击“选择”按钮。FlowJo 将显示一个对话框,告知您文件已重新连接。
请注意,FlowJo 将在文件夹级别加载文件,因此无需单独加载每个文件。
分析现在可以继续。
选项 2-单击导航操作带内的添加样本按钮(默认位于 FlowJo 选项卡内)。
浏览到文件所在的位置,选择文件夹并单击“选择”。FlowJo 将自动重新连接文件。请注意,这不会复制工作区内的样本,只会重新连接现有文件。不会出现重新连接对话框,但圆形徽章上的红色 X 将消失。
分析现在可以继续。
为什么会发生这种事?
当保存为工作区文件(V10 为 .WSP 文件,V9 为 .JO 文件)时,FlowJo 不会将原始样本文件保存为工作区的一部分。相反,FlowJo 会保存一组 FCS(或包含 FCS 的 LMD)文件的相对路径,并在每次打开工作区时根据需要访问这些文件。FlowJo 这样做主要是因为将文件与工作区一起存储需要 FlowJo 复制样本文件中的所有数据,从而导致工作区文件非常大,并实质上浪费了磁盘存储空间。
如果您曾经打开过工作区并被提示定位 FCS 文件,这几乎总是由于示例文件的文件路径发生变化而导致的。
以下是一些示例:
整个目录从一个网络存储移动到另一个网络存储文件路径中的文件夹更改名称包含工作区所知道的 FCS 文件的文件夹被留在办公室/实验室上面的两个重新连接文件选项可以轻松解决上述两个示例。但让我们详细阐述一下第三个示例:
您完成了本周的工作并计划在家进行分析。您将 FlowJo 工作区保存到拇指驱动器中,然后在家用电脑上打开它。当您在家用电脑上打开工作区时,所有样本现在都显示为断开的红色 X。如果家用电脑上没有样本文件,您必须开车回到办公室并将样本文件保存到拇指驱动器,然后开车回家,然后才能进行分析。
那么你可以做些什么来避免这种情况呢?
选项 1 – 将工作区和原始示例文件一起保存在一个文件夹中,并将所有内容传输到您的拇指驱动器,然后通过向 FlowJo 显示新的文件位置路径重新连接家用计算机上的示例文件。选项 2 – 将工作区保存为档案流式细胞术标准 (ACS) 文件。
保存为 ACS 文件。
如果硬盘空间不是问题,FlowJo 10 允许您使用下一代存档流式细胞术标准 (ACS) 文件格式保存工作区。这会将 FCS 文件和工作区分析中的所有信息保存到一个(非常大的)文件中。但是,如果您想在计算机之间传输,或者有足够的硬盘空间,那么这可能是一个不错的选择。使用 ACS,原始数据将始终与分析一起移动。