从 FlowJo 导出数据对各种任务都很有帮助。例如，您可能需要通过将多个文件合并在一起（连接）来创建新的FCS文件以方便进行罕见事件分析，或者导出包含工作区结构（门控树和列）的 CSV 文件以供下游应用程序使用。
以下部分介绍如何使用位于文档操作带中的导出/连接选项将数据直接从工作区导出为 FCS 或 CSV 文件。
要了解如何保存工作区 (WSP)、工作区模板 (WSPT)、档案流式细胞术标准 (ACS) 或 Excel (XLS) 文件，请单击此处。
要了解如何从图形窗口直接导出，请单击此处。
要了解如何从表编辑器导出数据，请单击此处。
要了解如何从布局编辑器导出数据，请点击此处。
将数据导出为新的 FCS 或 CSV 文件。
导出可以按组或单个样本级别进行，导出所有事件或单个门控群体。
要导出组内的所有文件，请在“组”窗口中突出显示相应的组。
要导出组内的单个样本，请在样本窗口中突出显示一个或多个样本（例如，如下所示的前五个样本）。
要导出特定的门控群体，请突出显示门控树中的门控子集（按组或单个样本）。
接下来，在工作区功能区的文档带内（默认位于文件选项卡内），单击数据导出/连接操作按钮。
从下拉列表中根据需要选择“导出/连接群体”或“导出/连接组”。
这将打开以下“导出”或“连接”窗口。
基本导出选项 –
输出
允许您从下拉列表中选择文件格式（FCS3、CSV-Scale 值或 CSV-Channel 值）。您还可以选择将保存新文件的目标文件夹。
包括事件
允许您导出文件中的所有事件（全部包含），或通过指定较少数量的事件（不超过：）导出总数的代表性子集。在后一种情况下，FlowJo 将随机从文件中删除事件，直到达到指定的事件数。如果您正在处理非常大的数据文件并且只需要检查一小部分事件，这将非常有用：将它们导出到单独的文件通常会使分析更快、更高效。
参数
允许您选择所有补偿参数、所有未补偿参数或自定义设置。
高级导出选项 –
文件命名
单击高级选项栏将打开其他文件命名选项。您可以添加前缀或后缀以将这些文件与原始文件区分开来（默认情况下，导出时会添加前缀），甚至可以使用关键字构建自定义文件命名方案。
一旦按照您的需要设置了这些选项（窗口底部的 Status 部分显示将生成多少个文件），请单击对话框右下方的 Export 按钮。将出现以下对话框。
然后可以将导出的文件加载到您选择的现有工作区（选中现有工作区框并单击浏览目标按钮以选择现有工作区），或在新工作区中打开（选中新工作区框）。单击关闭按钮以应用。
导出的文件也可以被其他应用程序读取。
将数据连接（合并）到新的 FCS 或 CSV 文件中。
连接功能可以在组级别或单个样本上执行。
要将多个文件连接在一起，首先选择要合并的样本或群体。在“组”窗口中突出显示组，或在“样本”窗口中突出显示样本，然后单击“文档”带中的“导出/连接”操作按钮。从下拉列表中根据需要选择“导出/连接群体”（或组）。这将打开“导出”或“连接”窗口。
单击此窗口中的“连接”按钮和“高级选项”栏，查看所有可能的连接选项。在下面的示例中，我选择将一个组中的 9 个文件连接在一起形成一个 FCS。
基本连接选项 –
输出
与标准文件导出一样，您可以从下拉列表中选择文件格式（FCS3、CSV-Scale 值或 CSV-Channel 值），以及选择将保存新文件的目标文件夹。
包括事件
此选项目前正在导出/连接平台中构建，在连接期间显示为灰色/不可操作。您可以通过执行以下操作来限制连接文件中的事件数量：
连接您的文件。打开步骤 1 中合并的文件。（可选）对连接的文件进行门控。使用下采样插件对连接的文件或总体进行下采样。导出下采样的总体。此选项将允许您限制最终连接文件中的事件总数。或者，您可以先对各个样本文件进行下采样，然后连接以产生类似的结果。
参数
允许您写入所有未补偿的参数数据、所有补偿的参数数据或自定义集。请注意，如果您想将文件带回 FlowJo，请始终保留默认选择（所有未补偿的参数）。如果您要合并的样本应用了补偿矩阵，则该矩阵将写入新文件，并且补偿参数将可用。
高级连接选项 –
单击高级选项栏将打开其他文件命名、组连接和附加参数选项。
文件命名
可以添加前缀和/或后缀，或者可以使用关键字构建自定义文件命名方案。
群组串联
指定是否将所有文件合并为一个文件（将所有文件连接在一起），或者可以应用重复的连接操作（将每“n”个文件连接在一起 n = __）。或者，可以选择关键字参数作为鉴别器（连接具有相等关键字值的文件）。
其他参数
允许在连接过程中创建额外的新参数。
一旦根据需要设置了连接选项（窗口底部的“状态”部分显示将生成多少个文件），请单击对话框右下方的“连接”按钮。将出现以下对话框。
然后可以将导出的文件加载到您选择的现有工作区（选中现有工作区框并单击浏览目标按钮以选择现有工作区），或在新工作区中打开（选中新工作区框）。单击关闭按钮以应用。
